Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USF2Q15853 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USF2Q15853 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USF2Q15853 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USF2Q15853 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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