Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.433e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ZBTB44-208ENST00000529348 2158 ntTSL 25.51□□□□□ -1.533e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 PICALM-206ENST00000526907 737 ntTSL 55.14□□□□□ -1.593e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.613e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZBTB44-209ENST00000529982 2629 ntTSL 24.69□□□□□ -1.663e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZBTB44-206ENST00000527478 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 53.5□□□□□ -1.853e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-20■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-20■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-20■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 317.54■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 317.37■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 314.8□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 NFIA-209ENST00000476646 730 ntTSL 34.43□□□□□ -1.76e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 315.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 RPL22-202ENST00000462296 600 ntTSL 38.41□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-17■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 SMIM8-205ENST00000448282 1214 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SMIM8-204ENST00000392863 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SMIM8-201ENST00000229570 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.95e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SMIM8-203ENST00000369572 737 ntTSL 58.95□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ARHGAP17-207ENST00000571480 645 ntTSL 416.2■□□□□ 0.186e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.746e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 ARHGAP17-203ENST00000455311 810 ntTSL 59.32□□□□□ -0.926e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 ARHGAP17-219ENST00000575975 681 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.246e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 BTBD1-205ENST00000560015 608 ntTSL 26.21□□□□□ -1.426e-8■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 TRAF3-209ENST00000560463 701 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 SPATS2-212ENST00000549298 643 ntTSL 323.93■■□□□ 1.429e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 SPATS2-218ENST00000551540 720 ntTSL 522.83■■□□□ 1.259e-8■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.929e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 NSD2-221ENST00000511904 690 ntTSL 57.94□□□□□ -1.149e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 NSD2-211ENST00000502425 421 ntTSL 36.78□□□□□ -1.329e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.94e-10■■■■□ 26.4
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TARDBPQ13148 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.075e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 UBAP2L-211ENST00000456325 812 ntTSL 317.83■□□□□ 0.445e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 UBAP2L-210ENST00000441890 678 ntTSL 217.4■□□□□ 0.385e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 UBAP2L-204ENST00000368504 1120 ntTSL 514.33□□□□□ -0.125e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 RARA-207ENST00000475125 813 ntTSL 510.93□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 26.4
TARDBPQ13148 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.293e-8■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-8■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.433e-8■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-207ENST00000531990 868 ntTSL 220.33■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-205ENST00000530384 1196 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-206ENST00000530961 1214 ntTSL 514.86□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-209ENST00000534763 777 ntTSL 212.74□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 CCS-202ENST00000525435 798 ntTSL 212.03□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 317.76■□□□□ 0.432e-10■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-10■■■■□ 26.3
TARDBPQ13148 HMBOX1-215ENST00000560599 1426 ntTSL 517.87■□□□□ 0.453e-8■■■■□ 26.3
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