Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms