Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELF3P78545 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ELF3P78545 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELF3P78545 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ELF3P78545 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ELF3P78545 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms