Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOMO3P69849 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOMO3P69849 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms