Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms