Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN5P51795 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms