Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX1P40424 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PBX1P40424 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX1P40424 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX1P40424 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX1P40424 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms