Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSP1P33241 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSP1P33241 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LSP1P33241 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSP1P33241 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSP1P33241 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSP1P33241 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSP1P33241 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms