Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP1P29466 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP1P29466 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms