Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GCSHP23434 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms