Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHGAP10645 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHGAP10645 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CHGAP10645 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHGAP10645 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHGAP10645 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHGAP10645 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHGAP10645 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHGAP10645 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHGAP10645 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHGAP10645 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHGAP10645 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHGAP10645 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHGAP10645 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms