Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSH2P0DML3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSH2P0DML3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms