Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAPPC2BP0DI82 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAPPC2BP0DI82 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms