Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCNP04198 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCNP04198 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCNP04198 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCNP04198 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYCNP04198 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYCNP04198 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYCNP04198 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCNP04198 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCNP04198 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms