Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM2O43147 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM2O43147 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms