Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms