Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 414.81□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 59.13□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 57.68□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 56.19□□□□□ -1.427e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.78□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.234e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 CPED1-208ENST00000495036 2198 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 36.5
UTP3Q9NQZ2 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.081e-323■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.688e-7■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 GLS-207ENST00000417154 837 ntTSL 311.45□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 GLS-209ENST00000461965 575 ntTSL 48.22□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 36.4
UTP3Q9NQZ2 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-204ENST00000466494 677 ntTSL 211.69□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-211ENST00000492240 964 ntTSL 59.98□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-203ENST00000415527 1135 ntTSL 515.47■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-206ENST00000431066 1847 ntTSL 511.96□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-208ENST00000443213 1903 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 510.57□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-203ENST00000518310 569 ntTSL 422.18■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-206ENST00000520534 635 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.714e-8■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 36.3
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-204ENST00000439930 1296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-212ENST00000598863 551 ntTSL 315.1■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-207ENST00000597095 536 ntTSL 28.85□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-208ENST00000597163 423 ntTSL 35.01□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 AC134978.1-201ENST00000579480 788 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-17■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 RPA1-202ENST00000570451 630 ntTSL 322.36■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 RPA1-203ENST00000571058 577 ntTSL 418.26■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 36.2
UTP3Q9NQZ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TARS-210ENST00000508361 2481 ntTSL 210.61□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TARS-212ENST00000509731 2170 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TARS-209ENST00000507716 2475 ntTSL 28.98□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 RAD23B-203ENST00000419616 716 ntTSL 320.21■□□□□ 0.834e-9■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 526.09■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 223.28■■□□□ 1.327e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.147e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 218.41■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 515.35■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 514□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 VCL-207ENST00000624354 3307 ntTSL 29.28□□□□□ -0.929e-7■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 424.47■■□□□ 1.512e-8■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 324.47■■□□□ 1.512e-8■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 418.9■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 318.58■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-203ENST00000502296 825 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 416.3■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 UBP1-208ENST00000467613 659 ntTSL 56.94□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 UBP1-203ENST00000411650 859 ntTSL 56.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 RAB6A-208ENST00000541795 1812 ntTSL 219.09■□□□□ 0.654e-9■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 DDX6-203ENST00000529162 1795 ntTSL 213.09□□□□□ -0.319e-15■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.349e-15■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ARRDC3-205ENST00000508948 564 ntTSL 49.12□□□□□ -0.954e-9■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.159e-15■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.279e-15■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 ARRDC3-204ENST00000507075 355 ntTSL 24.62□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.779e-15■■■■■ 36.1
UTP3Q9NQZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 36
UTP3Q9NQZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 36
UTP3Q9NQZ2 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 36
UTP3Q9NQZ2 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 515.5■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 36
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BN-202ENST00000449538 715 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 218.49■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 OTUB1-205ENST00000535140 638 ntTSL 319.53■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 OTUB1-204ENST00000447683 2315 ntTSL 217.52■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 MPP1-211ENST00000471821 558 ntTSL 215.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 PHC3-201ENST00000465896 538 ntTSL 512.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 OTUB1-207ENST00000536443 553 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 35.9
UTP3Q9NQZ2 CDK17-205ENST00000548734 556 ntTSL 48.55□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 35.9
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