Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 NISCH-205ENST00000467594 1014 ntTSL 214.47□□□□□ -0.097e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KRT8-214ENST00000551318 507 ntTSL 214.43□□□□□ -0.13e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-205ENST00000472680 440 ntTSL 314.26□□□□□ -0.133e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 214.11□□□□□ -0.152e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-227ENST00000638710 2327 ntTSL 513.87□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-205ENST00000462797 2000 ntTSL 513.79□□□□□ -0.24e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGPAT5-203ENST00000523234 2525 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DNMT1-217ENST00000589091 563 ntTSL 313.67□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DNM2-222ENST00000593220 561 ntTSL 313.52□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.48□□□□□ -0.253e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SHMT2-228ENST00000557302 457 ntTSL 313.14□□□□□ -0.314e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-231ENST00000638927 1457 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DNMT1-213ENST00000587604 513 ntTSL 213.03□□□□□ -0.323e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.353e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-270ENST00000640940 1764 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-220ENST00000638537 1902 ntTSL 512.39□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAPK6-203ENST00000558100 514 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-240ENST00000639239 505 ntTSL 212.34□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-263ENST00000640549 1437 ntTSL 512.2□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ACO2-205ENST00000478010 644 ntTSL 212.15□□□□□ -0.463e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 512.15□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 312.14□□□□□ -0.477e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-234ENST00000638962 2090 ntTSL 512.12□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-243ENST00000639292 1938 ntTSL 512.07□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM104A-207ENST00000583178 563 ntTSL 412.01□□□□□ -0.493e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NPM2-207ENST00000520180 417 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ELAVL1-203ENST00000595499 799 ntTSL 311.76□□□□□ -0.534e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-216ENST00000638415 1738 ntTSL 511.54□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PHYKPL-218ENST00000514424 584 ntTSL 411.49□□□□□ -0.575e-17■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-215ENST00000541099 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.594e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-212ENST00000492612 983 ntTSL 511.32□□□□□ -0.64e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-249ENST00000639872 1498 ntTSL 211.11□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KCTD6-206ENST00000491093 408 ntTSL 510.94□□□□□ -0.663e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-213ENST00000495175 1156 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.664e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 310.87□□□□□ -0.677e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ACTN4-206ENST00000489451 654 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-206ENST00000477307 1293 ntTSL 410.35□□□□□ -0.753e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-207ENST00000530833 724 ntTSL 310.1□□□□□ -0.797e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-211ENST00000491865 738 ntTSL 510.09□□□□□ -0.794e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.825e-9■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-266ENST00000640649 536 ntTSL 29.6□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TAF6-214ENST00000487115 384 ntTSL 29.46□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-207ENST00000421427 804 ntTSL 39.41□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGPAT5-202ENST00000518327 852 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RNF103-202ENST00000463333 686 ntTSL 59.15□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.957e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PIGT-241ENST00000639250 3363 ntTSL 58.87□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FN1-216ENST00000469569 629 ntTSL 28.7□□□□□ -1.027e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MYO5C-206ENST00000559434 2517 ntTSL 28.66□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-203ENST00000441669 1851 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.034e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DUS2-204ENST00000562246 736 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GMDS-AS1-204ENST00000525811 539 ntTSL 28.52□□□□□ -1.057e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BECN1-217ENST00000591085 559 ntTSL 48.51□□□□□ -1.052e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-203ENST00000395185 625 ntTSL 48.41□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-214ENST00000513996 944 ntTSL 38.27□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TRIT1-210ENST00000489945 861 ntTSL 58.19□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 WDFY2-202ENST00000460145 395 ntTSL 58.09□□□□□ -1.115e-9■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 28.07□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TMEM245-202ENST00000413712 1973 ntTSL 27.91□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ELAVL1-204ENST00000596154 880 ntTSL 37.91□□□□□ -1.144e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.154e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-206ENST00000420747 685 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FN1-218ENST00000473614 568 ntTSL 27.21□□□□□ -1.267e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FGG-209ENST00000465913 1573 ntTSL 26.86□□□□□ -1.312e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAPK6-208ENST00000560802 552 ntTSL 46.57□□□□□ -1.364e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GPAM-203ENST00000480130 514 ntTSL 26.46□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FN1-225ENST00000494446 676 ntTSL 26.12□□□□□ -1.437e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBM5-210ENST00000461242 275 ntTSL 56.11□□□□□ -1.433e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.442e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBM39-244ENST00000615771 686 ntTSL 55.94□□□□□ -1.465e-22■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-209ENST00000437725 545 ntTSL 45.55□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DNMT1-220ENST00000589351 672 ntTSL 25.14□□□□□ -1.593e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 34.89□□□□□ -1.632e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 LBR-204ENST00000424022 478 ntTSL 34.88□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.682e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.732e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 54.25□□□□□ -1.735e-22■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-210ENST00000453013 733 ntTSL 24.12□□□□□ -1.752e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 23.5□□□□□ -1.851e-22■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TFPI-205ENST00000417013 554 ntTSL 23.02□□□□□ -1.932e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAPK6-202ENST00000558063 583 ntTSL 43□□□□□ -1.934e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAPK6-206ENST00000560254 574 ntTSL 42.86□□□□□ -1.954e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.022e-6■□□□□ 10.5
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