Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VPS51Q9UID3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VPS51Q9UID3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms