Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYTL1Q9NRR1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms