Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSHZ2Q9NRE2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSHZ2Q9NRE2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSHZ2Q9NRE2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms