Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX2Q9NPC8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX2Q9NPC8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms