Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM9Q9C026 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM9Q9C026 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms