Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM34Q9BYJ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM34Q9BYJ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms