Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BAP1Q92560 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms