Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC190Q86UF4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms