Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms