Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC73Q6ZRK6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms