Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DUX4L9Q6RFH8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms