Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNIP4Q6PIL6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP4Q6PIL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms