Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP6Q5VW22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms