Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD12Q587J7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD12Q587J7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms