Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF4BQ13523 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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