Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLEQ07864 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLEQ07864 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLEQ07864 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLEQ07864 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLEQ07864 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLEQ07864 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms