Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACVR1Q04771 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACVR1Q04771 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms