Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A11Q02978 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A11Q02978 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms