Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUCB1Q02818 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUCB1Q02818 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms