Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX1P83916 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX1P83916 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX1P83916 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX1P83916 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX1P83916 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms