Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP9P55211 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP9P55211 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms