Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
RPS6KA3P51812 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS6KA3P51812 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms