Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A1P43005 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms