Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KB1P23443 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms