Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FDPSP14324 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FDPSP14324 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FDPSP14324 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FDPSP14324 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FDPSP14324 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FDPSP14324 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FDPSP14324 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDPSP14324 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDPSP14324 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDPSP14324 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDPSP14324 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDPSP14324 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FDPSP14324 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDPSP14324 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDPSP14324 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms