Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSPG5O95196 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG5O95196 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms