Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAF5O00463 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAF5O00463 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms