Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-205ENST00000638779 1983 ntTSL 523.87■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 519.69■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-201ENST00000638968 3175 ntTSL 517.96■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 512.54□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 56.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-217ENST00000492998 745 ntTSL 319.08■□□□□ 0.641e-24■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-212ENST00000480646 614 ntTSL 315.01□□□□□ -0.011e-24■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 XIST-202ENST00000417942 724 ntTSL 38.35□□□□□ -1.073e-11■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 XIST-203ENST00000421322 446 ntTSL 26.07□□□□□ -1.443e-11■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 MAP1S-212ENST00000597681 947 ntTSL 321.39■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 MAP1S-213ENST00000597735 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.83■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 ZMYM4-203ENST00000457946 6003 ntTSL 56.31□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP2-202ENST00000442798 1976 ntTSL 215.7■□□□□ 0.14e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 40.8
UTP3Q9NQZ2 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 59.98□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-15■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 510.24□□□□□ -0.774e-15■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 EEF2-203ENST00000596417 218 ntTSL 210.86□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 312.34□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 40.7
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.88□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 NOL3-206ENST00000564992 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.28■■□□□ 18e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 NOL3-203ENST00000563439 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.05■□□□□ 0.968e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.958e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 NOL3-208ENST00000565645 519 ntTSL 419.55■□□□□ 0.728e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 NOL3-207ENST00000565560 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.6■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.854e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 CDV3-204ENST00000503932 563 ntTSL 422.72■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 EDC4-202ENST00000536072 2375 ntTSL 218■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-224ENST00000560616 988 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 EDC4-208ENST00000574770 1425 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 EFTUD2-206ENST00000586654 585 ntTSL 210.4□□□□□ -0.745e-10■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 EFTUD2-221ENST00000591856 366 ntTSL 38.66□□□□□ -1.025e-10■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 314.36□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 MOGS-206ENST00000462189 2400 ntTSL 214.19□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 214.1□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 40.6
UTP3Q9NQZ2 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-206ENST00000478283 2594 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.826e-9■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-203ENST00000474884 864 ntTSL 518.86■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-207ENST00000496288 879 ntTSL 218.66■□□□□ 0.586e-9■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.456e-9■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.16e-9■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.276e-9■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 40.5
UTP3Q9NQZ2 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 333.77■■■■□ 33e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 324.66■■□□□ 1.543e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 NOSIP-202ENST00000593345 933 ntTSL 312.59□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.596e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.486e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)24.22■■□□□ 1.476e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 323.75■■□□□ 1.396e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 218.79■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 216.63■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 FASN-212ENST00000637525 141 ntTSL 515.83■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 513.09□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 312.82□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 312.79□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 312.32□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 511.95□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A1-202ENST00000524995 953 ntTSL 321.27■■□□□ 13e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 518.72■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 416■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 416■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 216■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 SYPL1-201ENST00000011473 2127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 40.4
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-205ENST00000527322 1000 ntTSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 40.4
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