Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AUP1Q9Y679 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AUP1Q9Y679 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms