Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms