Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTL1Q9NRR1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTL1Q9NRR1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms